商代隶定国，称桃林。周代为畿内地，录虢国(北虢)，称“渭汭”。春秋时称桃林塞，隶晋。晋侯使詹嘉处暇守此防秦。战国，秦厉共公二十四年(前453)隶魏。 秦惠文王六年(前332)，设宁秦县， 属宁秦县辖地。汉高祖五年(前202)，设船司空衙门，专管黄、渭河水运、船库。后以船司空官名为县名，隶京兆尹。新莽始建国元年(9)，改船司空县为船利县，隶后承烈郡。 东汉复名船司空县， 隶司隶校尉部。 建安十八年(213)，船司空县并入华阴，隶京兆尹。后经三国、魏、晋275年均属华阴县。北魏永熙三年(534)，属定城县(治所在今公庄村北之定)，隶华州华山郡。西魏时定城县并入敷西县，直至北周。
隋开皇三年(583)，属敷西县隶华州。大业三年(607)改隶京兆郡。五年(609)改敷西县为华阴县，潼关属之。唐垂拱元年(685)，华阴县改称仙掌县，天授二年(691)分仙掌县东部(潼关)设潼津县，隶虢卅。圣历二年(699) 三月，改属太州(治所在今华县)。长安二年(702)撤潼津县，并入仙掌县。
神龙二年(706)复名华阴县，本县属之。 后经五代、宋、金、元约670余年，均属华阴县。明洪武七年(1374)设潼关守御千户所，属陕西都司。九年(1376)，设潼关卫，属河南都司(明顾祖禹著《读史方舆纪要》说洪武三年设潼关卫)。永乐六年(1408)，属中军都督府。
清雍正二年(1724)撤潼关卫，五年(1727)，设潼关县。乾隆十三年(1748) 改设潼关厅，属陕西潼商道同州府。 民国二年(1913)废厅，设潼关县，属陕西省关中道。二十二年(1933)， 属陕西省。二十八年(1939)属陕西省第八区行政督察专员公署(治所在大荔 县)。三十六年(1947)属陕西省第二区行政督察专员公署(治所在华县)，直至解放。
1949年5月29日潼关解放，本县属渭南专员公署，隶陕甘宁边区政府。1950年5月，属渭南专员公署，隶陕西省人民政府。1956年10月，渭南专员公署撤销后，直属陕西省人民政府，1958年12月本县与渭南县合并后，设潼关人民公社， 属渭南县，隶陕西省人民政府。1961年8月15日恢复潼关县制，属渭南专员公署(1979年改称渭南地区行政公署)，隶陕西省人民政府，至今。
